MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus LOCK908

Total Repeats: 8671

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021725	CTATTA	2	12	1463	1474	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_021725	TATAT	2	10	1487	1496	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021725	AT	4	8	1493	1500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021725	ACG	2	6	1504	1509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021725	AGG	2	6	1513	1518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021725	A	6	6	2695	2700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021725	T	6	6	2730	2735	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021725	TCC	2	6	2959	2964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_021725	GCAA	2	8	2987	2994	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_021725	ATT	2	6	3024	3029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021725	TAA	2	6	3035	3040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021725	TTTA	2	8	3045	3052	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021725	TAAAA	2	10	3091	3100	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021725	GAT	2	6	3127	3132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021725	T	6	6	3176	3181	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021725	TAGGC	2	10	3302	3311	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_021725	G	6	6	3371	3376	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021725	T	6	6	3428	3433	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021725	TAAT	2	8	3450	3457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021725	TGG	2	6	3488	3493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021725	GAG	2	6	4874	4879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021725	GAG	2	6	6894	6899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021725	CAT	2	6	9670	9675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_021725	CTG	3	9	9800	9808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_021725	AAAT	2	8	9866	9873	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021725	T	6	6	9891	9896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021725	AAC	2	6	9950	9955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_021725	GTT	2	6	9977	9982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021725	AAAAT	2	10	10024	10033	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021725	T	6	6	10059	10064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021725	TTA	2	6	10091	10096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021725	TAT	2	6	10109	10114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021725	T	7	7	10120	10126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021725	GAAA	2	8	10128	10135	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021725	TTA	2	6	10151	10156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021725	TAA	2	6	10237	10242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021725	A	6	6	11774	11779	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021725	GTA	2	6	12030	12035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021725	T	6	6	12078	12083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021725	AGA	2	6	12084	12089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021725	A	6	6	12096	12101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021725	A	7	7	12126	12132	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021725	AAT	2	6	12164	12169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021725	TAA	2	6	12243	12248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021725	ACT	2	6	13756	13761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_021725	CTT	2	6	13904	13909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_021725	GGT	2	6	14226	14231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021725	ATT	2	6	14283	14288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021725	AGT	2	6	14974	14979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021725	TTA	2	6	15039	15044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021725	AGG	2	6	15084	15089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021725	AGG	2	6	16094	16099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021725	T	7	7	16389	16395	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021725	AT	3	6	17162	17167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021725	AT	3	6	17308	17313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021725	TA	3	6	17362	17367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021725	ATTTG	2	10	17371	17380	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021725	AGG	2	6	17401	17406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021725	ATA	2	6	19949	19954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021725	AGG	2	6	19969	19974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021725	A	6	6	20201	20206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021725	CTAA	2	8	20212	20219	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_021725	CA	3	6	20242	20247	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_021725	GGT	2	6	20409	20414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021725	GAA	2	6	20427	20432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021725	GTTT	2	8	20436	20443	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021725	ACA	2	6	20626	20631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_021725	TTC	2	6	20670	20675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_021725	AAGA	2	8	20680	20687	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021725	GTA	2	6	20697	20702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021725	TGA	2	6	20715	20720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021725	ATT	2	6	20730	20735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021725	TTTA	2	8	20827	20834	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021725	ACG	2	6	20898	20903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_021725	GTT	2	6	20997	21002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021725	AGCAG	2	10	21110	21119	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_021725	ATT	2	6	21234	21239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021725	ATA	2	6	21240	21245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021725	AAG	2	6	21299	21304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021725	A	7	7	21370	21376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021725	T	7	7	21442	21448	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021725	ATTT	2	8	21467	21474	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021725	T	6	6	21488	21493	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021725	ATAC	2	8	22256	22263	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_021725	AGTG	2	8	22358	22365	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021725	A	7	7	22376	22382	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021725	ATTC	2	8	22389	22396	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_021725	CAG	2	6	22429	22434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_021725	TTA	2	6	24567	24572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021725	GAT	2	6	24712	24717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021725	GAC	2	6	24724	24729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_021725	TAAA	2	8	24795	24802	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021725	TTTC	2	8	25786	25793	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_021725	T	6	6	25828	25833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021725	TCT	2	6	25938	25943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_021725	AAT	2	6	25945	25950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021725	TCA	2	6	25958	25963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_021725	AT	3	6	25982	25987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021725	GGC	2	6	26008	26013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_021725	AAT	3	9	26038	26046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021725	AAC	2	6	26065	26070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_021725	CTG	2	6	26113	26118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_021725	GGGC	2	8	26132	26139	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
104	NC_021725	CAA	2	6	26148	26153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_021725	TGCG	2	8	26174	26181	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_021725	TCC	2	6	26195	26200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_021725	ATG	2	6	26218	26223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021725	CAA	2	6	26226	26231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_021725	TTG	2	6	26351	26356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021725	AC	3	6	26369	26374	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_021725	TTTG	2	8	26395	26402	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021725	GGC	2	6	26439	26444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_021725	AGG	2	6	28711	28716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021725	A	6	6	28787	28792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021725	GTT	2	6	28822	28827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021725	TTAT	2	8	28835	28842	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021725	GGGT	2	8	28899	28906	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021725	TTAA	3	12	30177	30188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021725	CCT	2	6	33655	33660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_021725	GTT	2	6	33709	33714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021725	TAA	2	6	33719	33724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021725	TGT	2	6	33773	33778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021725	GCC	2	6	34380	34385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_021725	ATG	2	6	35610	35615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021725	CGC	2	6	35660	35665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_021725	GCG	2	6	35686	35691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_021725	TTGC	2	8	35695	35702	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_021725	TGC	2	6	36507	36512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_021725	TCA	2	6	36609	36614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_021725	AAG	2	6	36655	36660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021725	ACG	2	6	37274	37279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_021725	AT	3	6	37291	37296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021725	TGA	2	6	37329	37334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021725	ATC	2	6	37348	37353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_021725	T	6	6	37364	37369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021725	CAAA	2	8	37458	37465	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_021725	TAAAGG	2	12	37504	37515	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021725	CAA	2	6	38534	38539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_021725	GAT	2	6	38542	38547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021725	GTAT	2	8	38552	38559	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021725	AG	3	6	38580	38585	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021725	T	6	6	38632	38637	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021725	A	6	6	38675	38680	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021725	AC	3	6	40203	40208	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_021725	TCA	2	6	40246	40251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_021725	AGAA	2	8	40297	40304	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021725	TCT	2	6	40307	40312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_021725	GATTT	2	10	41059	41068	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021725	TTG	2	6	41139	41144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_021725	T	6	6	42950	42955	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_021725	ATGA	2	8	42958	42965	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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296	NC_021725	A	6	6	79719	79724	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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432	NC_021725	AT	3	6	130032	130037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
433	NC_021725	A	6	6	130078	130083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
434	NC_021725	CTT	2	6	130747	130752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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436	NC_021725	AACCA	2	10	130888	130897	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
437	NC_021725	CCT	2	6	132678	132683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
438	NC_021725	G	6	6	133642	133647	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
439	NC_021725	CAT	2	6	133659	133664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
440	NC_021725	CGT	2	6	133671	133676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
441	NC_021725	TAGC	2	8	133713	133720	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
442	NC_021725	TAA	2	6	133730	133735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
443	NC_021725	TGC	2	6	133858	133863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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445	NC_021725	CGG	2	6	136447	136452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
446	NC_021725	T	7	7	136456	136462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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448	NC_021725	AGCC	2	8	136716	136723	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
449	NC_021725	ATG	2	6	136898	136903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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451	NC_021725	ATAA	2	8	138411	138418	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
452	NC_021725	TGG	2	6	139644	139649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
453	NC_021725	A	6	6	139674	139679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
454	NC_021725	CTTT	2	8	142661	142668	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
455	NC_021725	TCC	2	6	143759	143764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
456	NC_021725	TGA	2	6	143865	143870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
457	NC_021725	ATT	2	6	143890	143895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
458	NC_021725	A	6	6	143920	143925	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
459	NC_021725	CCT	2	6	144834	144839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
460	NC_021725	ATC	2	6	144843	144848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
461	NC_021725	GTA	2	6	144849	144854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
462	NC_021725	TGC	2	6	144905	144910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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466	NC_021725	A	6	6	145740	145745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
467	NC_021725	GAT	2	6	145792	145797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
468	NC_021725	ATT	2	6	145814	145819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
469	NC_021725	T	6	6	145818	145823	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
470	NC_021725	AAC	2	6	150043	150048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
471	NC_021725	ATAA	2	8	151174	151181	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
472	NC_021725	TTCG	2	8	151183	151190	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
473	NC_021725	ATT	2	6	151218	151223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
474	NC_021725	TCA	2	6	151243	151248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
475	NC_021725	GAG	2	6	151303	151308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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477	NC_021725	TTAA	2	8	152617	152624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
478	NC_021725	AAG	2	6	152636	152641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
479	NC_021725	A	6	6	152956	152961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
480	NC_021725	GTT	2	6	153004	153009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
481	NC_021725	ATT	2	6	153052	153057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
482	NC_021725	GGC	2	6	155413	155418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
483	NC_021725	AGA	2	6	155518	155523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
484	NC_021725	ATT	2	6	155553	155558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
485	NC_021725	CAT	2	6	155574	155579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
486	NC_021725	CGAA	2	8	155694	155701	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
487	NC_021725	TGT	2	6	156967	156972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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489	NC_021725	TA	3	6	157042	157047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
490	NC_021725	GCA	2	6	157094	157099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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492	NC_021725	CAT	2	6	158346	158351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
493	NC_021725	GGA	2	6	158352	158357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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496	NC_021725	AGC	2	6	160304	160309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
497	NC_021725	GAAT	2	8	160326	160333	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
498	NC_021725	GCT	2	6	160361	160366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
499	NC_021725	ATG	2	6	160406	160411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
500	NC_021725	TA	3	6	160421	160426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

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